Muzeum Piernika mieści się w zabytkowej kamienicy na toruńskiej Starówce, blisko najznamienitszych toruńskich zabytków. Ulica Rabiańska, na której pod numerem 9 mieści się muzeum, zaczyna się wspaniałą Katedrą Św. Janów, kończy zaś znaną wszystkim i podziwianą Krzywą Wieżą.