W ciągu ostatnich dwóch lat sprzedaż leków refundowanych spadła o ok. 4 mld złotych, głównie z powodu niekorzystnych dla hurtowników i aptekarzy marż. Jak wynika ze statystyk branży farmaceutycznej, aż 60 proc. sprzedaży leków wypisywanych na receptę przynosi sprzedawcom straty. Powoduje to, że w ich ofercie pojawia się coraz więcej parafarmaceutyków, czyli leków sprzedawanych bez recepty.

Po dwóch latach finansowej zapaści w wyniku konsekwentnej realizacji kompleksowego programu restrukturyzacji, unowocześniania i przyspieszenia rozwoju, w 2010 roku PKP Cargo zbilansowało swoją działalność. Spółka przekształciła się w jedną z nielicznych tego typu firm w Europie przynoszącą zysk ze sprzedaży i bilansowy zysk netto.